Medikamenter kan påvirke både tarmens funksjon og avføringskonsistensen. Dette kan føre til en diarètilstand, enten som følge av en forstoppelse eller løs avføring. Løs avføring kan disponere for analinkontinens. Eksempler på slike medikamenter er antibiotika, statiner, antidepressiva, morfinpreparater, nevroleptika, laxantia og metformin.